ОАО «НИУИФ» выполняет работы в области охраны окружающей среды в соответствии с Федеральным Законом «Об охране окружающей среды и действующими требованиями природоохранного законодательства РФ.

Основные направления деятельности института в этом направлении:
– создание экологически безопасных и ресурсосберегающих технологий и аппаратуры для широкого круга фосфор- и азотсодержащих минеральных удобрений, фосфорной, серной, азотной, кремнефтороводородной кислот и их производных, технических солей и минеральных кормовых средств для животноводства;

– создание технологий утилизации многотоннажных отходов производств (отработанная серная кислота, сероводород, фосфогипс, фтор и серосодержащие газы).